Das Weindorf Ebernburg wird urkundlich erstmals 1237 erwähnt. Die beim Ort gelegene Burg wurde um das Jahr 1000 von den Grafen von Veldenz gebaut. Nach mehreren Besitzwechseln 1482 ging die Herrschaft von Ebernburg mit einem Schloss, und den Dörfern Fell, Bingert und Norheim in den Besitz von Schweikhardt von Sickingen (gest. 1505) über.

Ab 1448 besiedelten die Sickinger die Burg. Ihre Hochzeit erlebte die Ebernburg dann unter Franz von Sickingen (1481-1523), der auf der Burg geboren war. Ulrich von Hutten (1488-1523) bezeichnete die Burg als „Herberge der Gerechtigkeit“. Die Blütezeit der Sickinger ging bis zum Jahr 1523, als Franz von Sickingen an den Folgen einer Kriegsverletzung starb. Im Anschluss zerstörten seine Gegner, ein Fürstenzusammenschluss um Kurtrier, alle seine Burgen und brannten die Ebernburg am 11. Juni 1523 nach einer Belagerung nieder. Franz` Sohn, Franz Konrad Freiherr von Sickingen (1511 oder 1514 - 1574 oder 1585), baute die Burg später wieder auf. [Anm. 1]  

1978 wurden Bad Münster am Stein Ebernburg Stadtrechte verliehen. Als Begründung wurden hierfür u.a. genannt: die positive Entwicklung durch die Modernisierung der Kureinrichtungen, die Erstellung neuer Gästeunterkünfte, die Erweiterung der Bebauungsmöglichkeiten für eine höhere Einwohnerzahl und die Umwandlung des Kur- und Salinenbetriebs in einen kommunalen Eigenbetrieb. [Anm. 4] Zum 1. Juli 2014 wurde Bad Münster am Stein-Ebernburg ein Stadtteil der Nachbarstadt Bad Kreuznach. [Anm. 5]