Der älteste Bodenfund auf dem Gebiet des heutigen Mainz-Laubenheim wird in die Jüngere Steinzeit (Neolithikum) datiert. Es handelt sich um ein Holzbearbeitungsgerät, einen sogenannten Schuhleistenkeil aus der Bandkeramik-Kultur. Mitglieder dieser Kultur siedelten um 5300 bis 4800 v. Chr. in Weisenau und werden dabei auch die Laubenheimer Gründe zur Jagd und zum Fischfang genutzt haben. Erste dauerhaftere Siedlungen sind in der Älteren Urnenfelderzeit (1200 bis 1000 v. Chr.) und der Hallstattzeit belegt (750 bis 450 v. Chr.).

Aus der Jungsteinzeit stammt möglicherweise auch ein sogenannter Menhir, ein über zwei Meter großer pfeilförmiger Kalkstein, der im Mittelalter als Grenzstein verwendet wurde.

In römischer Zeit verlief eine Straße nahe der späteren Ortslage, welche die römischen Militärlager von Mainz und Weisenau mit dem in Nierstein verband. In der Nähe dieser Route wissen wir durch Gebäudereste von zwei villae rusticae, die als kleine Bauerngehöfte wohl auch die nahe gelegenen Siedlungen versorgten (sogenannte vici, hier z.B. der vicus Aresacensis in Weisenau). Auch fanden Bestattungen in diesem Gebiet statt, die jedoch aufgrund der unzureichenden Funddokumentation nicht mehr zugeordnet werden können. Andere Steinartefakte, wie beispielsweise ein Votivaltar aus dem 1. Jahrhundert n. Chr., befinden sich heute im Landesmuseum Mainz.

Wie Mainz und das Umfeld der erzbischöflichen Residenzstadt wurde auch Laubenheim schwer vom Dreißigjährigen Krieg getroffen. Im Winter 1639/40 floh der Pfarrer Manfred Deul nach Mainz, um sich vor den Wirren des Kriegs zu schützen. Dort wurde er Opfer der Pestepidemie von 1666, während in Laubenheim selbst nur wenige Leute starben. In einer Volkszählung, die 1618 vor Ausbruch des Dreißigjährigen Kriegs und danach nochmals 1668, 20 Jahre nach dessen Ende, durchgeführt wurde, zählte man jeweils 72 Herdstätten (Haushalte). 1668 betrug die Einwohnerzahl Laubenheims 272 Personen. Nicht auszuschließen ist hierbei natürlich, dass die Zahlen nicht tatsächlich alle Bewohner erfasste und beispielsweise Gesinde nicht mitgezählt wurde. [Anm. 1]

Im Pfälzischen Erbfolgekrieg vertrieben die französischen Truppen im April 1689 die Einwohner Laubenheims auf die gegenüberliegende Seite des Rheins nach Ginsheim, wo sie neun Wochen ausharren mussten. Um die Franzosen aus Mainz zu vertreiben, belagerte die Augsburger Allianz die Stadt zwei Monate lang, was einen Ausbruch der Ruhr auslöste. Auch in Laubenheim starben deshalb 1689 von Anfang August bis Ende des Jahres 70 Menschen, ein Viertel der Bewohner.

Eine Überschwemmungskatastrophe 1882/83 zerstörte 96 von insgesamt 241 Häusern im Ort, weshalb einige Laubenheimer Familien in die Neue Welt, Amerika, auswanderten. Die Schäden konnten durch Spenden und staatliche Zuschüsse behoben werden. Ein Deichverband aus Bodenheim, Nackenheim und Laubenheim kümmerte sich um die Ausbesserung des gebrochenen Damms.

1850 gründete Christian Adalbert Kupferberg eine Schaumweinfabrik, deren erster Standort zunächst Laubenheim war. Bereits 1855 jedoch verlagerte die heute weit bekannte Kupferberg Sektkellerei ihren Sitz auf den Kästrich in Mainz. [Anm. 9]

Im Zweiten Weltkrieg wurde Laubenheim wiederholt bombardiert; der schwerste Angriff war der vom 1. Februar 1945 mit 25 Toten und der Zerstörung/Beschädigung von 65% der Gebäude. Entgegen der auch damals häufig geäußerten Vermutung, die Angriffe hätten einem Rüstungsbetrieb in den Stollen des Weisenauer Steinbruchs gegolten, steht für den Großangriff vom 1. Februar 1945 fest, dass er eigentlich der Stadt Mainz bestimmt war (und dort am 27. Februar "nachgeholt" wurde). [Anm. 11]

In den 1930er Jahren lebten zwei Juden in Laubenheim: der Arzt Sanitätsrat Dr. Bernhard Feist und Erich Baumann. Während Dr. Feist zwar Berufsverbot erhielt, aber durch das Eingreifen des damaligen Bürgermeisters vor den Novemberausschreitungen 1938 bewahrt blieb und in den frühen 40er Jahren starb, wurde Baumann zwar 1944 nach Theresienstadt deportiert, konnte aber fliehen und 1945 kurz nach dem Einmarsch der Amerikaner zurückkehren; er starb in den 1950er (?) Jahren. [Anm. 12]

Die Schäden konnten in den ersten Nachkriegsjahren so weit beseitigt werden, dass das Ortsbild der Vorkriegszeit heute weitgehend wiederhergestellt ist. Im Krieg fielen 133 Laubenheimer Soldaten und Zivilisten, seit 1939/45 sind 351 Soldaten aus der Gefangenschaft zurückgekehrt, während 50 noch immer als vermisst gelten. [Anm. 13]

Zwischen den Weltkriegen verzeichnete Laubenheim nur eine sehr langsame räumliche Ausweitung. Durch zahlreiche Neubauten in der zweiten Hälfte des 20. Jahrhunderts aber verlor der Ortskern seine Position in der Ortsmitte und damit seine Bedeutung als Zentrum des Ortes. Um den Longchamp-Platz war mit dem Rathaus, der Grundschule, dem damals noch einzigen katholischen Kindergarten und der Post eine Art soziales Gemeindezentrum entstanden, doch war Laubenheim zu diesem Zeitpunkt schon längst durch die Bahnstrecke zweigeteilt worden, die damals nur zwei beschrankte Übergänge hatte und den innerortlichen Verkehr deshalb erheblich behinderte. Am 23. Juni 1980 wurde schließlich eine Bahnüberführung mittels eines Tunnels an der Rheintalstraße fertiggestellt.

Der größte Laubenheimer Industriebetrieb ist die 1947 gegründete Firma Zöller, heute Zöller Kipper GmbH. Landwirtschaftliche Betriebe verzeichnen einen Rückgang von 73 (1968) auf 15 (1988). Auch der Weinbau war nach dem Zweiten Weltkrieg erheblich zurückgegangen, kurz danach noch tätige Hobbywinzer sind wegen des Wettbewerbsdrucks nicht länger aktiv. Nichtsdestotrotz ist Laubenheim einer der letzten vier noch weinbautreibenden Ortsbezirke von Mainz. Die Winzer präsentieren ihre Weine seit 1974 bei dem überregionalen Rebblütenfest in Laubenheim. [Anm. 18]