Den finanziellen Grundstock zur Gründung einer Johanniterkommende in Sobernheim legten Niederadlige des Nahe-Hunsrück-Raumes, welche sich offenbar schon aus Standesgründen dem Ritterorden verbunden fühlten. Eine Ordenskapelle wird erstmalig im Jahre 1382 erwähnt. Von ihr sind nur die Reste in unteren Teilen des Langhauses erhalten. In der ersten Hälfte des 15. Jahrhunderts wurde das Langhaus durch einen Neubau ersetzt.

Nachdem in der zweiten Hälfte dieses Jahrhunderts das Ehepaar Johann Boos von Waldeck und dessen Frau Ida von Frankenstein der Kommende eine bedeutende Schenkung zukommen ließ, konnten eine Erweiterung des Kommendegeländes und die Errichtung einer größeren Kapelle in Angriff genommen werden. Unter der Leitung des damaligen Komturs Johann Stude entstanden der noch heute stehende Chor und die östlichen Langhauswände. Der Bauherr wurde in der Kapelle beigesetzt. Seine Grabplatte wurde in die Turmhalle der katholischen Pfarrkirche transloziert. Eine Weiterführung der Baumaßnahme am Langhaus wurde aber aufgegeben. [Anm. 1]

An weitere Stifter erinnern die Wappen auf dem Sturz über dem Westfenster. Neben dem bereits genannten Ehepaar Boos von Waldeck/Frankenstein ist dort das Wappen der Lander von Sponheim angebracht.

Diese Ritterfamilie bewohnte die Festung Nohfels auf der anderen Naheseite und hatte sich die Kapelle zu ihrer Grablege gewählt. Erhalten sind zwei Grabmäler. Das eine des Gerhard Lander von Sponheim von 1436 wurde anlässlich der Restaurierungsarbeiten im Jahre 1999 wiederentdeckt und liegt nun im Chorscheitel unter dem neu verlegten Holzboden. Das andere zeigt das Ehepaar Gerhard Lander von Sponheim und Katharina von Nieder-Flörsheim, den Mann in voller Rüstung und die Ehefrau, wie sie ihrem Mann einen Helm reicht. Das kunsthistorisch bedeutsame Grabmal wurde – wie das des Komturs Johann Stude – beim Bau der katholischen Pfarrkirche St. Matthäus in die dortigen Turmhalle transloziert. Ebenso wurde aus der Kapelle der spätgotische Sakramentsschrein dorthin überführt und in die Nordwand des Chores eingelassen.

Das Sakralgebäude diente als Ordenskapelle, bis der pfälzische Landesherr Friedrich III. [1559-1576] nach Regierungsantritt die Reformation in Sobernheim einführte. Die Ordensgeistlichen verließen die Stadt. Der Ordensbesitz verblieb jedoch weiter bei den Johannitern, deren katholischer Zweig sich seit der Reformation Malteserorden nannte. Die Kapelle wurde nun als Ökonomiegebäude genutzt und zerfiel. 

Beim Aushub des Fußbodens entdeckte man drei bisher unbekannte Grabplatten. Die von Gerhard Lander von Sponheim (+ 1433) wurde bereits erwähnt. Die beiden anderen waren Wirtschaftsverwalter des Baron von Leyen in Weiler. Sie wurden unter den Fußboden im Chorscheitel verlegt.

Erhalten ist nur das Wohngebäude, welches der Komtur Jakob von Duding im Jahre 1750 erbauen ließ. Es beherbergte von 1821 bis 1960 die höhere Schule und wird heute vom benachbarten Amtsgericht genutzt.