Eine Kirche in Wiesoppenheim wird erstmals 1234 erwähnt, als das Wormser Domkapitel dem Dompropst Nibelung unter anderem die Patronatsrechte der Kirchen in Wiesoppenheim und Heppenheim überließ. Die Ursprünge dieser Kirche reichen vermutlich bis in fränkische Zeit zurück. Als Hinweise darauf können die Zugehörigkeit des Ortes zu einem ehemaligen fränkischen Königsgut sowie das Patrozinium des heiligen Martin angesehen werden, der als fränkischer Reichsheiliger gilt. Auch das fränkische Gräberfeld, das in der Gemarkung in der Nähe der heutigen Kapelle zur Schmerzhaften Muttergottes gefunden wurde und das frühchristliche Grabbeigaben beinhaltete, deutet auf einen fränkischen Ursprung der Wiesoppenheimer Kirche hin. [Anm. 1] Der Ort gelangte über kaiserliche Schenkungen in den Besitz des Bistums Worms, das nicht nur die geistliche, sondern auch die weltliche Herrschaft über das Dorf ausübte.

Die Unterhaltspflicht der Kirche und die Finanzierung der Gottesdienste waren zwischen dem Domkapitel, dem Domprobst und der Gemeinde aufgeteilt. Der Dompropst war für den Chor verantwortlich. Das Domkapitel hingegen war für die Unterhaltung des Kirchenschiffs zuständig und hatte Kelch, Messbuch, Gewänder, Messwein und Leuchter bereitzustellen. Die Gemeinde musste den Taufstein, die Friedhofsmauer und das Beinhaus, sowie den Turm, die Glocken, die Fahnen und das Weihwasserbecken unterhalten. Die Kirche scheint dennoch nicht gut in Stand gehalten worden zu sein. So wird in einem Visitationsbericht von 1496 von der Verwahrlosung der Kirche und der Baufälligkeit des Pfarrhauses berichtet. [Anm. 2]

Obwohl Wiesoppenheim eine eigene Pfarrei bildete, scheint die Gemeinde im Mittelalter keinen eigenen Pfarrer gehabt zu haben. Gottesdienste wurden nur unregelmäßig von verschiedenen Geistlichen gehalten. Warum der Domprobst keinen Geistlichen fest anstellte, ist nicht überliefert, allerdings verfügte die Pfarrei nur über geringe Einkünfte, sodass das Interesse an der Pfarrstelle wohl gering ausfiel. [Anm. 3]

Der Wormser Bischof verlor im 16. Jahrhundert zunehmend an Einfluss. Weite Teile des Wormser Hochstifts gingen verloren und die sich ausbreitende Reformation bedrohte zudem die geistliche Vorherrschaft des Bischofs, der die Autorität über zahlreiche Pfarreien verlor. Die weltliche Herrschaft über Wiesoppenheim und den anderen sogenannten Rheindörfern war zwischen dem Wormser Bischof und den Grafen von Nassau aufgeteilt, die ihren Anteil als Lehen des Bischofs hielten. In den 1540er Jahren wurde in den Rheindörfern Wiesoppenheim, Horchheim und Weinsheim durch Graf Philipp III. von Nassau-Weilburg (1504–1559) gegen den Willen des Wormser Bischofs die Reformation eingeführt. Im benachbarten Horchheim sind daher ab 1548 lutherische Prediger nachweisbar, deren Gottesdienste auch von Wormser Bürger:innen besucht wurden.

In den Rheindörfern Wiesoppenheim, Horchheim und Weinsheim wurde in den 1540er Jahren durch Graf Philipp III. von Nassau-Weilburg (1504–1559) gegen den Willen des Wormser Bischofs die Reformation eingeführt. Im benachbarten Horchheim sind daher ab 1548 lutherische Prediger nachweisbar, deren Gottesdienste auch von Wormser Bürger:innen besucht wurden. [Anm. 4]

Die Spannungen zwischen Katholiken und Protestanten verschärften sich zunehmend und bildeten schließlich den religiösen Vorwand für den blutigen Machtkampf der europäischen Mächte, der zum Ausbruch des Dreißigjährigen Krieges (1618–1648) führte. In den folgenden Jahren bestimmte der Kriegserfolg, welche Konfession in den einzelnen Dörfern verbreitet wurde. 1625 setzte der Wormser Bischof Georg Friedrich von Greiffenclau zu Vollrads (1573–1629) den lutherischen Pfarrer in Horchheim ab und ließ die Rheindörfer rekatholisieren. 1627 verbot der Wormser Bischof zudem den Einwohner:innen in den Rheindörfern bei hohe Strafe, in anderen Orten lutherische Gottesdienste zu besuchen und den protestantischen Glauben auszuüben. Mit dem Eingreifen des schwedischen Königs Gustav II. Adolf (1594–1632) auf protestantischer Seite konnte der reformierte Glauben 1630 wieder Fuß fassen. Spätestens nach der Niederlage der schwedischen Truppen bei der Schlacht von Nördlingen 1634 wurde wieder katholische Glauben verbreitet. Der Dreißigjährige Krieg fand mit dem Westfälischen Frieden 1648 ein Ende.

Die Jesuitenpatres von Worms, die seit 1606 in der Stadt tätig waren, unterstützten auch die Seelsorge in Wiesoppenheim, Horchheim und Weinsheim. 1669 wurden sie offiziell mit der Betreuung der Pfarrei Horchheim beauftragt und angewiesen sich auch um Wiesoppenheim zu kümmern und in beiden Orten Gottesdienste zu lesen. Diese Regelung wurde auch beibehalten, nachdem die Jesuiten 1688 die Pfarrstelle an einen Pfarrer übergaben. Damit verlor die Pfarrei Wiesoppenheim weite Teile ihrer Unabhängigkeit. Die Gemeinde führte jedoch weiterhin eigene Kirchenbücher und 1674 wurde ein Taufstein in der Kirche aufgestellt, was nur in Pfarrkirchen erlaubt war. Wiesoppenheim scheint damit nicht vollständig zu einer Filialgemeinde geworden zu sein. Dennoch blieben Versuche der Gemeinde, wieder die vollständige Unabhängigkeit zu erreichen, in den folgenden Jahrhunderten ohne Erfolg. [Anm. 5]

In der Nachkriegszeit wurde in Wiesoppenheim eine Schwesternstation in einem geerbten Gebäude in der Theodor-Storm-Straße eröffnet. Im Hof und Garten dieser Schwesternstation wurde 1954/55 ein neuer Kindergarten errichtet, der von den Ordensschwestern geführt wurde. Im September 1976 wurde die Schwesternstation aufgelöst. Der Kindergarten verblieb in der Trägerschaft der katholischen Gemeinde.

Anfang der 1970er Jahre wurde der Innenraum der Wiesoppenheimer Pfarrkirche völlig neugestaltet. Die alte, überwiegend dunkle Innenausstattung der Kirche wurde bis auf die Empore fast vollständig entfernt. Der Fußboden wurde aufgebrochen, die Fenster ausgebrochen und der Chorraum erweitert. Die Decke wurde unter Betonung der Querbalken neubemalt. Die Orgel von 1876 wurde generalüberholt und ergänzt. Beim Abbruch des alten verschnörkelten Altars wurde eine historische Altarplatte entdeckt, die zuletzt wohl im 15. Jahrhundert bearbeitet worden war. Diese Platte wurde neu gefasst und geglättet und dient seitdem auf vier runden Säulen als Hauptaltar der Kirche. Der alte Taufstein wurde im nördlichen Chorraum aufgestellt. Die historischen Figuren des heiligen Martin von 1540 und des heiligen Sebastian von 1600 wurden in Konsolen an den Seitenwänden des Kirchenschiffs untergebracht. Darüber hinaus wurden neue Buntglasfenster von Glasmaler Heinz Hindorf aus Michelstadt gestaltet, die Szenen des Alten und Neuen Testaments zeigen. [Anm. 9]

Die katholische Gemeinde Wiesoppenheim bildet heute gemeinsam mit den Gemeinden Horchheim, Weinsheim, Offstein und Heppenheim die Pfarrgruppe Katholische Kirche im Eisbachtal. In der Reform des Bistums Mainz im Zuge des sogenannten Pastoralen Wegs sollen die Gemeinden mit zahlreichen weiteren Gemeinden der Stadt Worms und des Umkreises den neuen Pastoralraum Worms und Umgebung bilden. [Anm. 10]